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如果发现手机号码被别人注册为公司联系方式，可以采取以下步骤进行起诉。
1、收集证据：收集所有可能的证据，包括手机号码、通信记录、短信、电话录音等，证明该手机号码是你的，并且被错误地注册为公司联系方式。
2、寻找法律帮助：寻求专业的法律咨询，以了解详细的法律程序和维权方式。
3、提交诉讼：前往当地法院提交诉讼，要求对方停止使用你的手机号码，并消除其对你的不良影响。
4、提交相关证据：在诉讼过程中，向法院提交收集到的证据，以证明对方的行为对你的权益造成了侵害。
具体的法律程序和维权方式可能因地区和具体情况而异，在采取任何行动之前，最好咨询专业的律师以获取详细的法律建议，如果你认为你的个人信息被滥用或存在其他违法行为，也可以向公安机关报案。